Beyond Flesh and Blood ist ein Third-Person-Mech-Shooter, der den Spieler in die dystopische Zukunft des Jahres 2281 versetzt. Die letzten überlebenden Menschen haben sich auf eine riesige Raumstation im Orbit der Erde zurückgezogen, da auf der Planetenoberfläche noch immer Kriege toben. Von dort aus kontrollieren sie per gedankenbetriebener VR-Steuerung die Mechs, die sie in den Kampf auf die Erde (anfangs in die Ruinen von Manchester) schicken. Der Spieler schlüpft in die Rolle von Ethan, einem der letzten Menschen und Mech-Piloten, der versucht, den Frieden auf der Welt wiederherzustellen.